La Massachusetts Bay Company se formó en 1628 como una empresa conjunta para comerciar con el pescado y las pieles de Nueva Inglaterra. Pero desde el principio, varios de sus líderes, en particular John Winthrop (1588-1649), quisieron utilizarlo como vehículo para promover una comunidad religiosa puritana. Los puritanos estaban descontentos con el progreso de la reforma en la Iglesia de Inglaterra y también estaban alarmados por el estallido de la Contrarreforma en Europa, para restablecer la supremacía de la Iglesia Católica Romana. Su última esperanza de reforma aparentemente se perdió cuando el rey Carlos I (1600-1649) disolvió el Parlamento y comenzó un período de gobierno absolutista. En consecuencia, Winthrop y sus colegas puritanos compraron a sus colegas de mentalidad más comercial en agosto de 1629 y zarparon hacia América en marzo de 1630, llevándose la carta con ellos. Pero antes de irse, la empresa celebró una última reunión en la que Winthrop fue elegido gobernador con un consejo de dieciocho asistentes de ideas afines. La transformación de la empresa en una comunidad religiosa se fortaleció aún más a su llegada a Massachusetts, donde el Tribunal General de la empresa, integrado por el gobernador, el consejo y los hombres libres, aprobó una resolución que indicaba que, a partir de entonces, solo los miembros de pleno derecho de la iglesia podían participar en los asuntos de la colonia. .
Durante los siguientes dieciocho meses, Winthrop y los asistentes dirigieron la colonia casi como una teocracia. Hicieron concesiones de tierras a "los elegidos", como se conocía a los miembros de la iglesia, lo que les permitió establecer comunidades de convenio basadas en el principio congregacional. También emitieron leyes y ordenanzas sobre la vida cotidiana, utilizando la Biblia como guía. Todo esto contravenía el estatuto, que establecía que las leyes de la empresa debían ajustarse a las de Inglaterra. El estatuto también establecía que se celebrarían reuniones trimestrales del Tribunal General, y que el gobernador y el consejo deberían ser elegidos anualmente por los hombres libres de la empresa. Aunque la mayoría de la población quería vivir como buenos puritanos, todavía apreciaban sus derechos como ingleses. Por lo tanto, no pasó mucho tiempo antes de que la autoridad de Winthrop y el consejo fueran cuestionados, primero por el tema de los impuestos en 1632 y luego por el gobierno general de la colonia en 1634. Para la resolución de esta controversia fue fundamental la demanda de ver la carta , que Winthrop tenía en su custodia. La inspección de esto confirmó que el Tribunal General tenía el derecho exclusivo de aumentar los impuestos, hacer leyes y celebrar elecciones. Como resultado, Winthrop perdió su puesto como gobernador, aunque retuvo su lugar en el consejo y regresó debidamente durante la controversia antinomiana en 1636 cuando Anne Hutchinson (1591-1643) desafió las calificaciones requeridas para ser miembro de los elegidos. No obstante, se había establecido el principio de elecciones anuales, incluso si la participación todavía estaba restringida a los elegidos. Dado que la mayoría de los miembros de la iglesia ahora vivían fuera de Boston, optaron por enviar representantes en lugar de asistir a la Corte General en persona. Otro cambio fue la decisión de los representantes en 1644 de sentarse como una cámara separada, rompiendo finalmente el dominio del gobernador y el consejo. Massachusetts ahora tenía los ingredientes de una constitución y un sistema representativo de gobierno, todo basado irónicamente en su estatuto real como sociedad anónima.
Mientras tanto, las actividades de la Compañía de la Bahía de Massachusetts no habían pasado desapercibidas en Inglaterra, donde se hicieron llamamientos para que se investigara tanto sus actividades seculares como espirituales. Varias otras partes tenían reclamaciones sobre el área, mientras que la Iglesia Anglicana del arzobispo William Laud (1573-1645) estaba alarmada por la naturaleza disidente del acuerdo. En consecuencia, el rey Carlos I inició un procedimiento para anular el estatuto de la empresa. Afortunadamente para los puritanos, el rey pronto descubrió que tenía otros desafíos más urgentes en casa y tuvo que llamar al Parlamento. El estallido de la Guerra Civil Inglesa en 1641 protegió aún más a la Compañía de la Bahía de Massachusetts, especialmente cuando Oliver Cromwell (1599-1658) y los Puritanos Independientes salieron victoriosos. Massachusetts ahora tenía un gobierno amistoso en Inglaterra que protegería su política religiosa y civil. La década de 1650 resultó ser una época dorada para Massachusetts como comunidad autónoma e independiente.
La restauración de Carlos II (1630-1685) al trono en 1660, por lo tanto, fue un golpe para la gente de la Bahía de Massachusetts. Sin embargo, los puritanos de segunda generación siguieron el ejemplo de sus predecesores al intentar mantener a raya a las autoridades inglesas. En consecuencia, la colonia rechazó la solicitud de Carlos II de nombrar un gobernador. También mantuvieron la ficción de que su estatuto solo requería una lealtad nominal a la corona y que otorgaba al Tribunal General una autoridad paralela a la del Parlamento. Por lo tanto, cuando la corona exigió el cumplimiento de las leyes de la Ley de Navegación de 1660, 1663 y 1673 para controlar el comercio colonial en beneficio de la madre patria, Massachusetts simplemente aprobó una medida propia duplicada. Claramente, esta situación no podía continuar, y en 1684 la corona inició un procedimiento una vez más para anular el estatuto de la empresa. Esto se llevó a cabo en 1685. En el futuro, Massachusetts sería gobernado por un gobernador real, Sir Edmund Andros (1637-1714), con un consejo designado y sin asamblea representativa. Igualmente angustiosa para los puritanos fue la decisión de subsumir la colonia en una nueva entidad que se llamaría el Dominio de Nueva Inglaterra. Afortunadamente para Massachusetts, los intentos del rey Jaime II (1633-1701) de establecer una monarquía absoluta a ambos lados del Atlántico fueron anulados por los acontecimientos de la Revolución Gloriosa de 1689, que condujeron al acceso de Guillermo III y la reina María al trono inglés. . Sin embargo, no se volvería a la antigua carta de la compañía de 1629. Según la nueva carta de 1691, la corona nombraría al gobernador. Sin embargo, el hábil cabildeo de Increase Mather (1639-1723), el ministro divino más influyente de la provincia, aseguró que Massachusetts recuperara gran parte de lo que había disfrutado anteriormente. Los propietarios libres no solo elegirían una asamblea, sino que sus representantes, a su vez, nombrarían el consejo del gobernador, reflejando el antiguo estatuto de la empresa por el cual los hombres libres elegían el consejo de asistentes. Fue este sistema de gobierno el que sirvió al pueblo de Massachusetts hasta que comenzó la Guerra Revolucionaria Estadounidense en 1775.