Comité secreto del congreso. El Congreso creó este comité permanente (a veces confundido con el Comité de Correspondencia Secreta) el 18 de septiembre de 1775 con la responsabilidad de organizar la adquisición de suministros de guerra. Dados amplios poderes, grandes sumas de dinero y autorización para mantener en secreto sus procedimientos (destruyó muchos de sus registros), el Comité Secreto fue efectivo en gran parte gracias a su primer presidente, Thomas Willing, a quien sucedió en diciembre de 1775 su socio comercial, Robert Morris. (El 30 de enero de 1776, este último fue designado también para el otro comité secreto). Otros miembros originales fueron Benjamin Franklin, Silas Deane, Robert R. Livingston, John Alsop, John Dickinson, Thomas McKean, John Langdon y Samuel Ward. Los miembros de este comité tendían a ser hombres con experiencia en comercio exterior, lo que dio lugar a serios conflictos de intereses. Los mayores contratos fueron para la firma Willing y Morris; a familiares y amigos de Deane; ya firmas relacionadas con Alsop, Livingston y Francis Lewis (quienes posteriormente se unieron al comité). Las críticas a las actividades del comité aumentaron a medida que avanzaba la guerra, y Adams y Lee exigieron sin éxito una investigación sobre la especulación de la guerra.
La autoridad del Comité Secreto pronto se amplió para incluir suministros distintos de armas y municiones. En enero de 1776 se solicitó la importación de medicamentos, instrumentos quirúrgicos, mantas, artículos de algodón y varios metales. Pronto controló prácticamente todo el comercio exterior. Una de las operaciones más cuestionables del comité comenzó en enero de 1776, cuando el Congreso votó cuarenta mil libras para la importación de regalos indios; a los comerciantes contratantes se les permitió una comisión del 5 por ciento y el gobierno aseguró sus barcos contra las incautaciones británicas. Tres de los cuatro comerciantes contratantes eran miembros del Comité Secreto: Morris, Alsop y Lewis. El otro era Philip Livingston, primo de otro miembro del comité. En abril, se autorizó al Comité Secreto a armar y tripular embarcaciones en países extranjeros para el trabajo del Congreso, involucrándose así en el corso.
El organismo se lanzó audazmente al campo de los asuntos exteriores cuando, junto con el Comité de Correspondencia Secreta, envió a Silas Deane a Francia. Los asuntos de los dos comités secretos se complicaron desesperadamente a principios de 1777 cuando Franklin, Deane y Arthur Lee comenzaron sus deberes como comisionados de paz. Por lo tanto, el nombre del Comité Secreto se cambió en julio de 1777 a Comité de Comercio, que más tarde se convirtió en Departamento de Comercio, y el Comité de Correspondencia Secreta se convirtió en Comité de Asuntos Exteriores el 17 de abril de 1777.